Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba4aP68368 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tuba4aP68368 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba4aP68368 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tuba4aP68368 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tuba4aP68368 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms