Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk2bP67871 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk2bP67871 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Csnk2bP67871 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk2bP67871 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnk2bP67871 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk2bP67871 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2bP67871 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms