Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabrb3P63080 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabrb3P63080 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabrb3P63080 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrb3P63080 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrb3P63080 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrb3P63080 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrb3P63080 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabrb3P63080 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabrb3P63080 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabrb3P63080 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabrb3P63080 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gabrb3P63080 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabrb3P63080 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabrb3P63080 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrb3P63080 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrb3P63080 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrb3P63080 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabrb3P63080 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabrb3P63080 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrb3P63080 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gabrb3P63080 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gabrb3P63080 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gabrb3P63080 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gabrb3P63080 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrb3P63080 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrb3P63080 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrb3P63080 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrb3P63080 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gabrb3P63080 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabrb3P63080 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabrb3P63080 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabrb3P63080 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms