Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gnb1P62874 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gnb1P62874 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gnb1P62874 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gnb1P62874 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gnb1P62874 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gnb1P62874 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gnb1P62874 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gnb1P62874 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gnb1P62874 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gnb1P62874 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gnb1P62874 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnb1P62874 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnb1P62874 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnb1P62874 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnb1P62874 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnb1P62874 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms