Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl23aP62751 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl23aP62751 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl23aP62751 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpl23aP62751 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl23aP62751 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl23aP62751 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl23aP62751 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl23aP62751 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl23aP62751 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl23aP62751 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl23aP62751 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl23aP62751 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms