Protein–RNA interactions for Protein: P62137

Ppp1ca, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1caP62137 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1caP62137 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1caP62137 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1caP62137 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1caP62137 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1caP62137 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1caP62137 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp1caP62137 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1caP62137 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1caP62137 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1caP62137 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1caP62137 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1caP62137 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1caP62137 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1caP62137 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1caP62137 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1caP62137 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1caP62137 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1caP62137 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1caP62137 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1caP62137 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1caP62137 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1caP62137 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1caP62137 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms