Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrch1P62046 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrch1P62046 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrch1P62046 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrch1P62046 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrch1P62046 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrch1P62046 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lrch1P62046 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrch1P62046 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrch1P62046 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrch1P62046 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrch1P62046 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrch1P62046 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrch1P62046 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrch1P62046 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrch1P62046 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrch1P62046 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrch1P62046 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrch1P62046 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrch1P62046 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrch1P62046 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrch1P62046 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrch1P62046 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrch1P62046 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrch1P62046 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrch1P62046 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrch1P62046 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrch1P62046 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrch1P62046 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrch1P62046 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrch1P62046 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrch1P62046 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrch1P62046 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrch1P62046 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrch1P62046 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrch1P62046 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrch1P62046 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrch1P62046 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrch1P62046 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrch1P62046 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrch1P62046 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrch1P62046 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrch1P62046 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrch1P62046 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrch1P62046 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrch1P62046 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrch1P62046 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrch1P62046 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrch1P62046 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrch1P62046 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrch1P62046 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrch1P62046 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrch1P62046 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrch1P62046 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrch1P62046 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lrch1P62046 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lrch1P62046 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrch1P62046 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms