Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2mP61082 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2mP61082 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ube2mP61082 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube2mP61082 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2mP61082 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2mP61082 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2mP61082 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2mP61082 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2mP61082 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2mP61082 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2mP61082 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2mP61082 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2mP61082 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms