Protein–RNA interactions for Protein: P60003

Elof1, Transcription elongation factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elof1P60003 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elof1P60003 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elof1P60003 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elof1P60003 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elof1P60003 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Elof1P60003 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elof1P60003 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elof1P60003 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elof1P60003 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elof1P60003 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elof1P60003 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elof1P60003 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Elof1P60003 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms