Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gsc2P56916 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gsc2P56916 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gsc2P56916 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gsc2P56916 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gsc2P56916 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms