Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pex2P55098 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex2P55098 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pex2P55098 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex2P55098 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pex2P55098 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pex2P55098 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pex2P55098 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pex2P55098 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pex2P55098 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pex2P55098 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pex2P55098 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pex2P55098 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pex2P55098 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pex2P55098 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pex2P55098 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pex2P55098 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pex2P55098 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pex2P55098 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pex2P55098 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pex2P55098 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pex2P55098 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pex2P55098 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pex2P55098 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pex2P55098 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pex2P55098 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pex2P55098 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pex2P55098 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pex2P55098 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pex2P55098 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pex2P55098 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pex2P55098 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pex2P55098 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms