Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RabggtbP53612 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RabggtbP53612 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RabggtbP53612 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RabggtbP53612 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RabggtbP53612 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RabggtbP53612 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RabggtbP53612 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RabggtbP53612 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RabggtbP53612 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RabggtbP53612 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RabggtbP53612 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RabggtbP53612 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RabggtbP53612 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RabggtbP53612 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RabggtbP53612 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RabggtbP53612 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RabggtbP53612 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RabggtbP53612 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RabggtbP53612 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RabggtbP53612 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RabggtbP53612 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RabggtbP53612 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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