Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn1swP51491 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Opn1swP51491 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Opn1swP51491 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn1swP51491 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn1swP51491 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn1swP51491 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Opn1swP51491 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Opn1swP51491 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn1swP51491 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn1swP51491 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn1swP51491 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Opn1swP51491 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Opn1swP51491 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opn1swP51491 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms