Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brca1P48754 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brca1P48754 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brca1P48754 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brca1P48754 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brca1P48754 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brca1P48754 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brca1P48754 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brca1P48754 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brca1P48754 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brca1P48754 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brca1P48754 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brca1P48754 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brca1P48754 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brca1P48754 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brca1P48754 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brca1P48754 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Brca1P48754 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brca1P48754 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brca1P48754 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brca1P48754 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brca1P48754 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brca1P48754 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brca1P48754 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brca1P48754 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brca1P48754 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brca1P48754 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brca1P48754 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brca1P48754 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brca1P48754 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brca1P48754 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brca1P48754 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Brca1P48754 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brca1P48754 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brca1P48754 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brca1P48754 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brca1P48754 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brca1P48754 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brca1P48754 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brca1P48754 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Brca1P48754 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brca1P48754 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brca1P48754 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Brca1P48754 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Brca1P48754 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Brca1P48754 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brca1P48754 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brca1P48754 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brca1P48754 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brca1P48754 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brca1P48754 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brca1P48754 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms