Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox2P48432 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox2P48432 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox2P48432 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox2P48432 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox2P48432 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox2P48432 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox2P48432 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox2P48432 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox2P48432 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox2P48432 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox2P48432 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox2P48432 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox2P48432 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox2P48432 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sox2P48432 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox2P48432 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox2P48432 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox2P48432 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox2P48432 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox2P48432 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox2P48432 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox2P48432 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms