Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl6P47911 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl6P47911 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl6P47911 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl6P47911 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl6P47911 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl6P47911 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl6P47911 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl6P47911 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl6P47911 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl6P47911 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl6P47911 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl6P47911 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpl6P47911 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl6P47911 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl6P47911 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms