Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nedd4P46935 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nedd4P46935 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nedd4P46935 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nedd4P46935 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nedd4P46935 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Nedd4P46935 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nedd4P46935 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nedd4P46935 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nedd4P46935 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nedd4P46935 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nedd4P46935 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Nedd4P46935 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nedd4P46935 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nedd4P46935 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nedd4P46935 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nedd4P46935 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nedd4P46935 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nedd4P46935 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nedd4P46935 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Nedd4P46935 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nedd4P46935 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Nedd4P46935 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nedd4P46935 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nedd4P46935 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nedd4P46935 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nedd4P46935 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nedd4P46935 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nedd4P46935 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nedd4P46935 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nedd4P46935 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nedd4P46935 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nedd4P46935 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nedd4P46935 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nedd4P46935 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nedd4P46935 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nedd4P46935 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nedd4P46935 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Nedd4P46935 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nedd4P46935 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nedd4P46935 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nedd4P46935 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms