Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sar1aP36536 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sar1aP36536 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sar1aP36536 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sar1aP36536 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sar1aP36536 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sar1aP36536 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sar1aP36536 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sar1aP36536 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sar1aP36536 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sar1aP36536 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sar1aP36536 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sar1aP36536 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sar1aP36536 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sar1aP36536 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sar1aP36536 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sar1aP36536 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sar1aP36536 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sar1aP36536 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sar1aP36536 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sar1aP36536 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sar1aP36536 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sar1aP36536 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sar1aP36536 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sar1aP36536 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.3 ms