Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc3P33622 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apoc3P33622 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoc3P33622 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc3P33622 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc3P33622 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms