Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Notch4P31695 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Notch4P31695 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Notch4P31695 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Notch4P31695 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Notch4P31695 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Notch4P31695 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Notch4P31695 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Notch4P31695 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Notch4P31695 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Notch4P31695 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Notch4P31695 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Notch4P31695 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Notch4P31695 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Notch4P31695 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Notch4P31695 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Notch4P31695 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Notch4P31695 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Notch4P31695 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Notch4P31695 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Notch4P31695 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Notch4P31695 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Notch4P31695 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Notch4P31695 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Notch4P31695 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Notch4P31695 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Notch4P31695 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Notch4P31695 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Notch4P31695 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Notch4P31695 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Notch4P31695 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Notch4P31695 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Notch4P31695 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Notch4P31695 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Notch4P31695 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Notch4P31695 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Notch4P31695 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Notch4P31695 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Notch4P31695 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Notch4P31695 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Notch4P31695 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Notch4P31695 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Notch4P31695 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Notch4P31695 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Notch4P31695 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Notch4P31695 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Notch4P31695 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Notch4P31695 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Notch4P31695 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Notch4P31695 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Notch4P31695 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Notch4P31695 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms