Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Saa4P31532 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Saa4P31532 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Saa4P31532 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Saa4P31532 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Saa4P31532 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Saa4P31532 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Saa4P31532 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Saa4P31532 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Saa4P31532 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Saa4P31532 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Saa4P31532 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms