Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa4P28311 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa4P28311 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa4P28311 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa4P28311 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa4P28311 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa4P28311 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa4P28311 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms