Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2afxP27661 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2afxP27661 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2afxP27661 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2afxP27661 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2afxP27661 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2afxP27661 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2afxP27661 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2afxP27661 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2afxP27661 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2afxP27661 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2afxP27661 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H2afxP27661 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2afxP27661 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms