Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gadd45bP22339 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gadd45bP22339 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gadd45bP22339 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gadd45bP22339 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gadd45bP22339 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gadd45bP22339 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gadd45bP22339 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gadd45bP22339 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gadd45bP22339 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gadd45bP22339 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gadd45bP22339 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gadd45bP22339 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gadd45bP22339 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gadd45bP22339 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gadd45bP22339 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gadd45bP22339 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gadd45bP22339 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gadd45bP22339 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gadd45bP22339 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gadd45bP22339 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gadd45bP22339 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gadd45bP22339 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gadd45bP22339 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gadd45bP22339 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gadd45bP22339 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gadd45bP22339 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gadd45bP22339 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gadd45bP22339 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gadd45bP22339 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gadd45bP22339 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gadd45bP22339 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gadd45bP22339 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gadd45bP22339 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms