Protein–RNA interactions for Protein: P22005

Penk, Proenkephalin-A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PenkP22005 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PenkP22005 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PenkP22005 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PenkP22005 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PenkP22005 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PenkP22005 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PenkP22005 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PenkP22005 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PenkP22005 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PenkP22005 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PenkP22005 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PenkP22005 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PenkP22005 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PenkP22005 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PenkP22005 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PenkP22005 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PenkP22005 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PenkP22005 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PenkP22005 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PenkP22005 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PenkP22005 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PenkP22005 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PenkP22005 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PenkP22005 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PenkP22005 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PenkP22005 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PenkP22005 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PenkP22005 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PenkP22005 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PenkP22005 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PenkP22005 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PenkP22005 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PenkP22005 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PenkP22005 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PenkP22005 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PenkP22005 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PenkP22005 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PenkP22005 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PenkP22005 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PenkP22005 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PenkP22005 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PenkP22005 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PenkP22005 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PenkP22005 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PenkP22005 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PenkP22005 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PenkP22005 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PenkP22005 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PenkP22005 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PenkP22005 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PenkP22005 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PenkP22005 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PenkP22005 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PenkP22005 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PenkP22005 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PenkP22005 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PenkP22005 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PenkP22005 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PenkP22005 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PenkP22005 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PenkP22005 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PenkP22005 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PenkP22005 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PenkP22005 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PenkP22005 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PenkP22005 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PenkP22005 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PenkP22005 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PenkP22005 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PenkP22005 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PenkP22005 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PenkP22005 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PenkP22005 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PenkP22005 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PenkP22005 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PenkP22005 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PenkP22005 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PenkP22005 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PenkP22005 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PenkP22005 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PenkP22005 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PenkP22005 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PenkP22005 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PenkP22005 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PenkP22005 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PenkP22005 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PenkP22005 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PenkP22005 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PenkP22005 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PenkP22005 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PenkP22005 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PenkP22005 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PenkP22005 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PenkP22005 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PenkP22005 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PenkP22005 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PenkP22005 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PenkP22005 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PenkP22005 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PenkP22005 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms