Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ntf3P20181 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ntf3P20181 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ntf3P20181 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ntf3P20181 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ntf3P20181 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ntf3P20181 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ntf3P20181 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntf3P20181 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms