Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P18528 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P18528 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
P18528 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P18528 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P18528 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P18528 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P18528 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
P18528 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P18528 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P18528 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
P18528 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P18528 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P18528 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P18528 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P18528 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
P18528 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P18528 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
P18528 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P18528 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
P18528 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
P18528 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
P18528 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
P18528 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
P18528 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
P18528 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
P18528 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
P18528 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
P18528 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
P18528 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
P18528 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
P18528 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
P18528 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
P18528 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
P18528 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
P18528 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
P18528 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
P18528 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
P18528 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
P18528 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
P18528 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
P18528 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
P18528 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P18528 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P18528 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P18528 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P18528 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P18528 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P18528 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
P18528 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P18528 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P18528 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
P18528 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
P18528 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P18528 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
P18528 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
P18528 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P18528 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P18528 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P18528 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
P18528 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P18528 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P18528 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P18528 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P18528 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P18528 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
P18528 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P18528 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
P18528 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
P18528 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P18528 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
P18528 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P18528 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P18528 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P18528 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P18528 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P18528 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P18528 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P18528 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P18528 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P18528 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
P18528 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P18528 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P18528 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
P18528 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
P18528 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P18528 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P18528 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P18528 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P18528 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
P18528 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P18528 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P18528 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P18528 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P18528 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P18528 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P18528 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P18528 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P18528 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P18528 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms