Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ass1P16460 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ass1P16460 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ass1P16460 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ass1P16460 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ass1P16460 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ass1P16460 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ass1P16460 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ass1P16460 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ass1P16460 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ass1P16460 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ass1P16460 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ass1P16460 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ass1P16460 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ass1P16460 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ass1P16460 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ass1P16460 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ass1P16460 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ass1P16460 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ass1P16460 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ass1P16460 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ass1P16460 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms