Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-Q9P14431 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-Q9P14431 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-Q9P14431 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-Q9P14431 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-Q9P14431 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H2-Q9P14431 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-Q9P14431 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-Q9P14431 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-Q9P14431 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-Q9P14431 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-Q9P14431 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-Q9P14431 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-Q9P14431 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-Q9P14431 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-Q9P14431 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-Q9P14431 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2-Q9P14431 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-Q9P14431 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q9P14431 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q9P14431 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms