Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpsaP14206 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RpsaP14206 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RpsaP14206 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RpsaP14206 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RpsaP14206 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RpsaP14206 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RpsaP14206 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RpsaP14206 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RpsaP14206 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RpsaP14206 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RpsaP14206 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RpsaP14206 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms