Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp28P10078 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp28P10078 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp28P10078 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zfp28P10078 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zfp28P10078 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp28P10078 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms