Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pax1P09084 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pax1P09084 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pax1P09084 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax1P09084 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax1P09084 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax1P09084 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax1P09084 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pax1P09084 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax1P09084 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax1P09084 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pax1P09084 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pax1P09084 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pax1P09084 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax1P09084 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax1P09084 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pax1P09084 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax1P09084 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax1P09084 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax1P09084 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax1P09084 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax1P09084 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax1P09084 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax1P09084 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax1P09084 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms