Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-T23P06339 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-T23P06339 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-T23P06339 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-T23P06339 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-T23P06339 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-T23P06339 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-T23P06339 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-T23P06339 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-T23P06339 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-T23P06339 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-T23P06339 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-T23P06339 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-T23P06339 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-T23P06339 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-T23P06339 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms