Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtnd1P03888 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtnd1P03888 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd1P03888 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd1P03888 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd1P03888 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtnd1P03888 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtnd1P03888 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtnd1P03888 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtnd1P03888 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtnd1P03888 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mtnd1P03888 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mtnd1P03888 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms