Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01843 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01843 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01843 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01843 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01843 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01843 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01843 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01843 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01843 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01843 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01843 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01843 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01843 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01843 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01843 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01843 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01843 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01843 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01843 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01843 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01843 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01843 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01843 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01843 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01843 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01843 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01843 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01843 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01843 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01843 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01843 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01843 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01843 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01843 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01843 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01843 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01843 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01843 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01843 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01843 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01843 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01843 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01843 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01843 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01843 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01843 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01843 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01843 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01843 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01843 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01843 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01843 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01843 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01843 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01843 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01843 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01843 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01843 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01843 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01843 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01843 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01843 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01843 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01843 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01843 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01843 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01843 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01843 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01843 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01843 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01843 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01843 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01843 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01843 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01843 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01843 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01843 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01843 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01843 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01843 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01843 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01843 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01843 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01843 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01843 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01843 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01843 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01843 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01843 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01843 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01843 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01843 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01843 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01843 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01843 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01843 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01843 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01843 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01843 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms