Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01823 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01823 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01823 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01823 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01823 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01823 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01823 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01823 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01823 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01823 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01823 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01823 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01823 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01823 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01823 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01823 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01823 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01823 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01823 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01823 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01823 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01823 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01823 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01823 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01823 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01823 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01823 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01823 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01823 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01823 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01823 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01823 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01823 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01823 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01823 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01823 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01823 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01823 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01823 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01823 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01823 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01823 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01823 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01823 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01823 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01823 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01823 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01823 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01823 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01823 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01823 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01823 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01823 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01823 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01823 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01823 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01823 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01823 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01823 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01823 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01823 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01823 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01823 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01823 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01823 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01823 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01823 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01823 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01823 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01823 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01823 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01823 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01823 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01823 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01823 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01823 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01823 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01823 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01823 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01823 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01823 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01823 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01823 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01823 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01823 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01823 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01823 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01823 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01823 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01823 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01823 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01823 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01823 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01823 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01823 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01823 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01823 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01823 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01823 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms