Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01798 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01798 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01798 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01798 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01798 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01798 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01798 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01798 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01798 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01798 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01798 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01798 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01798 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01798 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01798 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01798 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01798 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01798 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01798 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01798 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01798 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01798 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01798 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01798 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01798 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01798 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01798 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
P01798 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01798 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01798 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01798 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01798 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01798 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01798 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01798 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01798 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01798 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01798 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01798 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01798 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01798 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01798 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01798 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01798 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01798 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01798 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
P01798 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01798 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01798 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01798 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01798 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01798 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01798 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01798 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01798 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01798 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01798 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01798 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01798 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
P01798 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01798 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01798 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01798 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01798 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01798 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01798 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01798 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01798 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01798 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01798 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01798 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01798 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01798 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01798 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01798 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01798 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01798 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
P01798 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01798 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01798 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01798 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01798 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01798 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01798 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01798 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01798 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms