Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Orc4O88708 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Orc4O88708 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Orc4O88708 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Orc4O88708 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Orc4O88708 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Orc4O88708 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Orc4O88708 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Orc4O88708 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Orc4O88708 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Orc4O88708 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Orc4O88708 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Orc4O88708 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Orc4O88708 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Orc4O88708 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Orc4O88708 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Orc4O88708 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Orc4O88708 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Orc4O88708 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Orc4O88708 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Orc4O88708 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Orc4O88708 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Orc4O88708 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Orc4O88708 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Orc4O88708 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Orc4O88708 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Orc4O88708 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Orc4O88708 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Orc4O88708 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Orc4O88708 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Orc4O88708 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Orc4O88708 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Orc4O88708 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Orc4O88708 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Orc4O88708 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Orc4O88708 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Orc4O88708 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Orc4O88708 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Orc4O88708 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Orc4O88708 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Orc4O88708 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Orc4O88708 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Orc4O88708 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Orc4O88708 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Orc4O88708 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Orc4O88708 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Orc4O88708 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Orc4O88708 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Orc4O88708 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Orc4O88708 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Orc4O88708 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Orc4O88708 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Orc4O88708 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Orc4O88708 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Orc4O88708 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Orc4O88708 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Orc4O88708 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Orc4O88708 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Orc4O88708 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.6 ms