Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hcn2O88703 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hcn2O88703 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hcn2O88703 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn2O88703 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn2O88703 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn2O88703 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn2O88703 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn2O88703 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hcn2O88703 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hcn2O88703 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hcn2O88703 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hcn2O88703 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hcn2O88703 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms