Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops3O88543 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops3O88543 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops3O88543 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops3O88543 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops3O88543 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops3O88543 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops3O88543 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops3O88543 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops3O88543 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops3O88543 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops3O88543 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops3O88543 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops3O88543 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops3O88543 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops3O88543 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops3O88543 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops3O88543 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops3O88543 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops3O88543 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops3O88543 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms