Protein–RNA interactions for Protein: O88513

Gmnn, Geminin, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmnnO88513 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GmnnO88513 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GmnnO88513 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GmnnO88513 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GmnnO88513 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GmnnO88513 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GmnnO88513 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GmnnO88513 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GmnnO88513 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GmnnO88513 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GmnnO88513 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GmnnO88513 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GmnnO88513 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GmnnO88513 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GmnnO88513 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GmnnO88513 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GmnnO88513 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GmnnO88513 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GmnnO88513 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GmnnO88513 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GmnnO88513 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GmnnO88513 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GmnnO88513 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GmnnO88513 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GmnnO88513 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GmnnO88513 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GmnnO88513 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GmnnO88513 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GmnnO88513 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GmnnO88513 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GmnnO88513 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GmnnO88513 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GmnnO88513 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GmnnO88513 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GmnnO88513 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GmnnO88513 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GmnnO88513 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GmnnO88513 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GmnnO88513 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GmnnO88513 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GmnnO88513 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GmnnO88513 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GmnnO88513 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GmnnO88513 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GmnnO88513 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GmnnO88513 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GmnnO88513 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GmnnO88513 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GmnnO88513 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GmnnO88513 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GmnnO88513 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GmnnO88513 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GmnnO88513 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GmnnO88513 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GmnnO88513 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GmnnO88513 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GmnnO88513 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GmnnO88513 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GmnnO88513 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GmnnO88513 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GmnnO88513 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GmnnO88513 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GmnnO88513 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GmnnO88513 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GmnnO88513 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GmnnO88513 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GmnnO88513 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GmnnO88513 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GmnnO88513 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms