Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh16O88338 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh16O88338 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh16O88338 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh16O88338 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh16O88338 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh16O88338 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh16O88338 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh16O88338 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh16O88338 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh16O88338 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh16O88338 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh16O88338 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh16O88338 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh16O88338 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh16O88338 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms