Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf12O35738 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klf12O35738 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf12O35738 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf12O35738 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf12O35738 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf12O35738 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf12O35738 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf12O35738 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf12O35738 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf12O35738 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf12O35738 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf12O35738 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf12O35738 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms