Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Stx1aO35526 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stx1aO35526 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stx1aO35526 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stx1aO35526 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stx1aO35526 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx1aO35526 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx1aO35526 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx1aO35526 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stx1aO35526 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stx1aO35526 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stx1aO35526 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stx1aO35526 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stx1aO35526 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx1aO35526 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx1aO35526 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stx1aO35526 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stx1aO35526 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stx1aO35526 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stx1aO35526 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stx1aO35526 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stx1aO35526 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stx1aO35526 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms