Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eftud2O08810 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eftud2O08810 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eftud2O08810 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eftud2O08810 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eftud2O08810 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms