Protein–RNA interactions for Protein: L7N2F1

Vmn1r31, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r31L7N2F1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r31L7N2F1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r31L7N2F1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r31L7N2F1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r31L7N2F1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r31L7N2F1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vmn1r31L7N2F1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r31L7N2F1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r31L7N2F1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r31L7N2F1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r31L7N2F1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r31L7N2F1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r31L7N2F1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r31L7N2F1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r31L7N2F1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r31L7N2F1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms