Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IfnabL7MTU6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IfnabL7MTU6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IfnabL7MTU6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IfnabL7MTU6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IfnabL7MTU6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IfnabL7MTU6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms