Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vwa3bJ9JI28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vwa3bJ9JI28 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vwa3bJ9JI28 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vwa3bJ9JI28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vwa3bJ9JI28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vwa3bJ9JI28 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vwa3bJ9JI28 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vwa3bJ9JI28 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vwa3bJ9JI28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vwa3bJ9JI28 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vwa3bJ9JI28 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vwa3bJ9JI28 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Vwa3bJ9JI28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vwa3bJ9JI28 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Vwa3bJ9JI28 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vwa3bJ9JI28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vwa3bJ9JI28 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Vwa3bJ9JI28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vwa3bJ9JI28 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vwa3bJ9JI28 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vwa3bJ9JI28 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vwa3bJ9JI28 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vwa3bJ9JI28 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vwa3bJ9JI28 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vwa3bJ9JI28 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Vwa3bJ9JI28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vwa3bJ9JI28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms