Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17577J3QNF7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17577J3QNF7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17577J3QNF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17577J3QNF7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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