Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20873J3QMQ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20873J3QMQ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20873J3QMQ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20873J3QMQ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20873J3QMQ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms